1、压力控制

实验室通风系统中，需要考虑压力控制，通常的生物化学实验室都要求保证实验室负压，防止实验室产生的毒害气体流入临近的办公区域，形成穿插污染。

2、便当日后的改造或扩建　

控制系统的设计应该尽量思索日后的改造和扩建。使得通风柜等设备的更新、移位、增加，实验室压力性的变换等尽量简单。

3、易维护

过于复杂的系统，常常需求定期维护，维护程序复杂并且费用高。所以一个良好的控制系统应该尽量简单牢靠，维护简单或者不需定期维护。

4、温馨

保证实验室适宜并且稳定的温湿度，气流稳定无异味，为实验室的工作人员提供一个温馨的工作环境，以进步工作效率。

5、安全

安全要素能够保证实验室内操作人员安全，以及保证实验室周边环境安全。各国关于实验室安全都有较为细致的标准，而安全也是实验室重要的目的之一。